明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……

毛依蘭，人稱“毛豆”，毛豆和董忱源系一脈，師出同門，無奈兩人自幼便是一對小冤家，逢則必斗。陰差陽錯間，毛豆成了董忱后廚一員，他手把手教她做菜，毛豆也漸漸陷入了他愛情的圈套，無奈董忱身邊鶯鶯燕燕絡繹不絕，因此兩人始終也不過是鐵哥們兒。在毛豆重蹈初戀的覆轍、擺脫相親對象的追求，并經歷了富二代的愛情之后，最終得到董忱的一顆真心。并且毛豆也在董忱的悉心教導和幫助下，逐漸成長為名副其實的“料理女王”。

死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據現代人的印象，呈現出與生前的人形不同的形態。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時代，述寫新的傳奇。作品獨創性的提出“魂”與“靈體”之間關系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來的一代又一代的人身上，并永不停息的持續著“他們”之間的戰爭，此所謂“魂戰紀”。