明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

在未來科學家制造了“盤古”這臺毀壞力超強的戰爭機器。公元2139年世界大戰爆發，“盤古”被用于戰爭。 世界大戰結束后，盤古被銷毀。 然而戰爭結束16年后，盤古神秘復活，并有自己的思想，覺得自己當年被遺棄，懷恨在心，決定復仇人類，自己制造出具有行動能力的機器，并開始大量制造各種戰爭機器人，開始報復人類，大舉進攻人類。

天授二年臘月，武則天詔令百花連夜開放。牡丹仙面臨選擇——開，就是順從；不開，就是死。桃花勸她低頭——不過百年，女皇就死了。牡丹仙說——我的選擇是不開。 她開始講述自己的故事。 上古時期，女媧造人，她是群體本性的象征。諸神祝福人類時，壽星公種下牡丹種子，牡丹仙誕生，代表對未來的希望。蒼天誕生，代表個體本性，與女媧展開戰爭。女媧補天，道隕化入萬靈，群體本性成為萬靈內心的聲音。 伏羲被困天庭，神農氏退位，帝俊蠱惑萬靈為妖，人妖大戰爆發。炎帝的安撫政策被蒼天陰謀破壞，被迫轉為鎮壓，萬靈投靠妖族，百年血戰。炎帝內疚殉道。蚩尤拒絕妖族幫助，獨自戰斗，被擒囚禁。 五帝時代，禪讓制是群體本性的最后堡壘。夏啟被蒼天蠱惑，武力奪位，廢除禪讓制，開啟家天下。“天下為公”變成“天下為家”，個體本性勝利。此后四千年，王朝循環，蒼天詛咒。 東漢末年，張角覺醒，高呼“蒼天已死，黃天當立”，黃巾起義失敗，但火種不滅。 牡丹仙在歷史中經歷了六世。第一世壽星紫，祝福未來，死于人妖大戰。第二世玉版白，祝福善意，陪伴曹植十年，殉情而死。第三世化為姚黃、魏紫、荷包牡丹，祝福愛情，千年后困惑而死。第四世洛陽紅，祝福反抗，在風雪中燃燒自己，鮮血化入泥土。 1949年，新中國成立。群體本性最終戰勝個體本性，“天下為公”回歸人間。 春天，邙山，六色牡丹同時綻放。牡丹仙站在花海中微笑。無數身影浮現——炎帝、蚩尤、張角、無數先烈。毛主席站在花海中，輕觸一朵洛陽紅。 待到山花爛漫時，他在叢中笑。

為了省錢，白予寧搬進兇宅，從此鬼影、淤青、鬼壓床輪番上陣。更離譜的是，爬上她床的那只鬼，竟是她死去多年的竹馬玩伴何安。何安失憶后一直渾渾噩噩地跟著她，直到她喊出他的名字，塵封的記憶才裂開一道縫——童年里，她是唯一對他好的人。白予寧念及舊情，決定幫何安找回記憶、送他投胎。兇宅里最特別的“同居”開始了。

天才少年林合在參加平南省少年乒乓球錦標賽時，遭受好朋友的背叛和陷害，而決心退出乒乓球運動的生涯。而在此時卻遇到了校痞曹斌，而重燃熱情，向新的目標開始迸發的熱血故事。

長生不死的陳起，每秒都會自動增加壽元，可在弱肉強食的修真界卻毫無作用。為了修習仙術進入落仙宗，卻意外加入老殘院，四個師傅都因為修習禁術而身體殘缺，而對于特殊特質的陳起來說，卻是如魚得水……